我校工会全称为中国教育工会广东海洋大学工会委员会，是在学校党委领导下由教职工自愿加入的工人阶级群众组织，是党委联系教职工群众的桥梁和纽带，是教职工利益的代表。我校工会设主席、常务副主席、副主席各1 人，委员16人，下设经费审查、女教职工、劳动权益争议调解、青年职工等4个工作委员会。工会日常办事机构为办公室、文体部和女工部。同时，依托各二级党组织，全校共成立25个部门工会，设主席、副主席各1人，委员若干人。目前，我校工会会员近2100人。

学校教代会挂靠在工会，工会承担教代会的日常工作。成立教代会执行委员会，设主任、副主任、秘书长各1人，委员20人，下设提案、民主评议、教职工福利等3个工作委员会。

1998年11月，学校召开首届教职工代表大会暨工会会员代表大会（以下简称“双代会”），至2018年3月，我校已召开至四届四次“双代会”。历年来，工会在学校党委和上级工会的正确领导下，紧密围绕学校的中心任务，认真履行工会“维护、建设、参与、教育”四项职能，充分发挥教代会“讨论、审议、决议、评议”基本职权，坚持党对工会工作的领导，坚持依法建会、依法治会、依法管会，团结和依靠广大教职工，在推进学校民主政治建设、维护教职工合法权益、丰富校园文化等方面发挥了积极作用，为学校的稳定和发展做出了重要贡献。

我校工会先后被授予“全国模范职工之家”，广东省“模范职工之家”、“工会女职工工作先进单位”和湛江市“职工之家”、 “民主管理先进单位”、“校务公开先进单位”、“职业道德建设先进单位”等荣誉称号。